MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	CAC	2	6	37	42	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019683	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
3	NC_019683	AAC	2	6	105	110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
4	NC_019683	GTT	2	6	179	184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722022
5	NC_019683	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722022
6	NC_019683	ACA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
7	NC_019683	GCG	2	6	364	369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722022
8	NC_019683	A	6	6	377	382	100 %	0 %	0 %	0 %	427722022
9	NC_019683	CCA	2	6	432	437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722022
10	NC_019683	GGT	2	6	482	487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
11	NC_019683	TGG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
12	NC_019683	CATC	2	8	633	640	25 %	25 %	0 %	50 %	427722022
13	NC_019683	CTG	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
14	NC_019683	AAG	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
15	NC_019683	TAGC	2	8	795	802	25 %	25 %	25 %	25 %	427722022
16	NC_019683	C	6	6	808	813	0 %	0 %	0 %	100 %	427722022
17	NC_019683	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
18	NC_019683	GATT	2	8	864	871	25 %	50 %	25 %	0 %	427722022
19	NC_019683	A	6	6	920	925	100 %	0 %	0 %	0 %	427722022
20	NC_019683	CCAC	2	8	975	982	25 %	0 %	0 %	75 %	427722022
21	NC_019683	CTG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
22	NC_019683	ATTG	2	8	1123	1130	25 %	50 %	25 %	0 %	427722022
23	NC_019683	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
24	NC_019683	CGC	2	6	1187	1192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722022
25	NC_019683	CA	3	6	1292	1297	50 %	0 %	0 %	50 %	427722022
26	NC_019683	A	6	6	1347	1352	100 %	0 %	0 %	0 %	427722022
27	NC_019683	TC	3	6	1353	1358	0 %	50 %	0 %	50 %	427722022
28	NC_019683	TC	3	6	1417	1422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019683	CAA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019683	A	6	6	1496	1501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019683	TTA	2	6	1520	1525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019683	TTTC	2	8	1532	1539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019683	AT	3	6	1584	1589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019683	A	6	6	1593	1598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019683	TC	3	6	1633	1638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019683	TAATT	2	10	1667	1676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019683	TGA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019683	A	6	6	1715	1720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019683	GGT	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722023
40	NC_019683	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
41	NC_019683	TTA	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
42	NC_019683	TTG	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019683	GCT	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722024
44	NC_019683	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722024
45	NC_019683	T	7	7	2015	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	427722024
46	NC_019683	GAG	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722024
47	NC_019683	ACC	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722024
48	NC_019683	TAA	2	6	2140	2145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722024
49	NC_019683	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722024
50	NC_019683	CAT	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722024
51	NC_019683	A	6	6	2240	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	427722024
52	NC_019683	TCTA	2	8	2294	2301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019683	TG	3	6	2313	2318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019683	GTG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019683	AGTGT	2	10	2379	2388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019683	ACTGG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019683	GGT	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
58	NC_019683	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
59	NC_019683	CAC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722025
60	NC_019683	ATGG	2	8	2575	2582	25 %	25 %	50 %	0 %	427722025
61	NC_019683	TTG	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
62	NC_019683	AGA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
63	NC_019683	GAT	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
64	NC_019683	A	6	6	2837	2842	100 %	0 %	0 %	0 %	427722025
65	NC_019683	TTA	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
66	NC_019683	TAT	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
67	NC_019683	AGG	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722025
68	NC_019683	TTG	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
69	NC_019683	TTGG	2	8	3109	3116	0 %	50 %	50 %	0 %	427722025
70	NC_019683	AGAAAG	2	12	3177	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
71	NC_019683	CAG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
72	NC_019683	AAG	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
73	NC_019683	GACA	2	8	3268	3275	50 %	0 %	25 %	25 %	427722025
74	NC_019683	TGA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
75	NC_019683	TGAT	2	8	3303	3310	25 %	50 %	25 %	0 %	427722025
76	NC_019683	TTA	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
77	NC_019683	GCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722025
78	NC_019683	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722025
79	NC_019683	TGG	3	9	3505	3513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
80	NC_019683	GCA	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
81	NC_019683	AAC	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722025
82	NC_019683	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019683	AG	3	6	3608	3613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019683	TGA	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019683	TTC	2	6	3713	3718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019683	TTC	2	6	3791	3796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019683	CAT	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019683	CTT	2	6	3837	3842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019683	GA	3	6	3864	3869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019683	AAAT	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019683	TCA	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019683	AACC	2	8	4016	4023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019683	AGC	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019683	GA	3	6	4071	4076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019683	TGG	2	6	4104	4109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019683	CGG	2	6	4215	4220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019683	ATG	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019683	GCT	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019683	CTT	2	6	4337	4342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019683	GAG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019683	CTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019683	ACTCT	2	10	4428	4437	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_019683	AGT	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019683	CTT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019683	AGT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019683	TGT	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019683	T	7	7	4570	4576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019683	ACT	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019683	TGA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019683	T	6	6	4701	4706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019683	GAG	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019683	GAC	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019683	TGCTT	2	10	4844	4853	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019683	T	6	6	4993	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019683	CTT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019683	GA	3	6	5044	5049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019683	AACC	2	8	5196	5203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019683	GA	3	6	5251	5256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019683	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019683	TGG	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019683	GTAG	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019683	TCCAC	2	10	5368	5377	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_019683	TCAC	2	8	5388	5395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019683	CTC	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019683	TGA	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019683	CAAT	2	8	5483	5490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019683	CTT	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019683	CGC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019683	GTT	2	6	5540	5545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019683	CAG	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019683	TGT	2	6	5560	5565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019683	CAT	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019683	GTG	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019683	TCT	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019683	CAG	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
136	NC_019683	C	6	6	5964	5969	0 %	0 %	0 %	100 %	427722026
137	NC_019683	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722026
138	NC_019683	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
139	NC_019683	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722026
140	NC_019683	CGG	2	6	6195	6200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722026
141	NC_019683	GCC	2	6	6270	6275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722026
142	NC_019683	TAA	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
143	NC_019683	AATC	2	8	6398	6405	50 %	25 %	0 %	25 %	427722026
144	NC_019683	AGC	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
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148	NC_019683	T	7	7	7123	7129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019683	T	6	6	7150	7155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019683	AT	3	6	7162	7167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019683	TGCC	2	8	7217	7224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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266	NC_019683	TAT	2	6	13577	13582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019683	ATAA	2	8	13597	13604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_019683	TC	3	6	13613	13618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
269	NC_019683	GA	3	6	13644	13649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019683	GAG	2	6	13707	13712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019683	CT	3	6	13727	13732	0 %	50 %	0 %	50 %	427722031
272	NC_019683	TGT	2	6	13765	13770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722031
273	NC_019683	A	6	6	13839	13844	100 %	0 %	0 %	0 %	427722031
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275	NC_019683	GTG	2	6	13878	13883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722031
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278	NC_019683	TG	3	6	13972	13977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019683	A	6	6	13979	13984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_019683	A	6	6	14517	14522	100 %	0 %	0 %	0 %	427722033
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